清税证明（电子版）：登录公司所属地电子税务局，在"我要办税"-"综合信息报告"-"状态信息报告"-"一照一码户清税申报"模块进行清税申报，提交成功后，可以通过"我要查询"-"办税进度及结果信息查询"模块查看受理进度，审核通过后，在“涉税文书查签”等相关功能中签收文书，下载电子版清税证明。

清税证明（纸质版）：纳税人可以携带相关资料到主管税务机关办税服务厅提交申请。资料通常都包括《清税申报表》、经办人身份证件原件等。具体可以咨询当地主管税务机关办税服务大厅。

电子版和纸质版《清税证明》的法律效力是相同的，其具体的使用场合可能因地区、部门或相关业务的要求而有所不同。