（一）贯彻执行国家卫生工作的方针、政策、法规和各项卫生技术标准并监督实施。
　　（二）制订并组织实施全市卫生事业发展的总体规划和计划；研究制订全市区域卫生规划，统筹规划与协调全市卫生资源配置；制订社区卫生服务发展规划和服务标准，并指导实施。
　　（三）制订全市卫生人才发展规划和卫生人员职业道德规范，参与组织卫生技术人员资格认定工作。
　　（四）研究并指导医疗机构改革，对卫生机构贯彻实施医疗质量标准和服务规范实行监督。
　　（五）贯彻党的中医政策，坚持中西医并重的方针，推进中医药的继承与创新，实现中医药现代化。
　　（六）依法监督管理采供血机构的采供血及临床用血质量。
　　（七）贯彻预防为主方针，制订社区健康教育规划，组织开展全民健康教育；研究制订对人群健康危害严重疾病的控制规划，组织对传染病、地方病和常见病、多发病等重大疾病的综合防治。
　　（八）依据卫生法律、法规、规章和标准，监督管理传染病防治和食品、化妆品、职业、环境、放射、学校卫生。
　　（九）研究制订全市基层卫生、妇幼卫生工作规划和起草政策措施，指导初级卫生保健规划和母婴保健专项技术的实施。
　　（十）制订全市重点医学科技、教育发展规划，组织重大医药卫生科研攻关，指导医学科技成果和新技术的普及应用。协助有关部门指导医学教育工作。
　　（十一）负责全市医疗卫生单位职业道德教育、法制教育，促进卫生行业的社会主义精神文明建设。
　　（十二）遇有重大突发事件和自然灾害，组织调度全市的卫生技术力量协助政府和有关部门抢救伤病员，防止和控制疾病的发生和蔓延。
　　（十三）承办市政府交办的其他事项。

    （一）办公室
　　开展综合性调研，起草全市卫生工作政策；综合协调机关事务，对领导交办的重要事项进行督促查办；负责综合文稿、文电、机要、保密、宣传、信息、档案、信访、接待、安全保卫及局机关的资产管理等工作。
　　（二）人事教育科
　　研究拟订全市卫生人才发展规划；负责所属单位高级知识分子的管理和卫生系统学科带头人的选拔、培养工作；负责机关和卫生系统的人事和机构编制管理工作；负责局机关退休离休人员的管理和服务工作，指导所属单位的老干部工作。协同有关部门做好全市卫生专业技术人员的资格认定工作；指导卫生系统的全市性表彰和医学群众团体的管理工作；负责有关外事工作；研究拟定全市重点医学科技发展规划，组织协调医药科研攻关，指导医学科技成果的普及应用工作；负责成人医学教育管理工作，指导医护人员规范化培训和继续医学教育管理工作；指导医学教育研究、重点专业实验室建设工作。
　　（三）规划财务科
　　拟定全市卫生事业发展规划，指导区域卫生规划工作；统筹规划与协调全市卫生资源配置；拟定并监督实施卫生财务管理规章；研究提出医疗卫生服务价格建议；监督管理市直卫生单位的国有资产；制定卫生基本建设管理办法；负责市直医疗卫生单位的计划、财务、基建、大型医疗设备的内部审计，指导全市医疗卫生单位的审计工作，指导全市大型卫生装备工作；负责全市卫生统计工作；协调国外卫生贷款的利用工作；负责局机关财务工作。
　　（四）卫生监督科
　　负责监督管理全市食品、保健品、化妆品、环境、学校、职业、放射卫生及传染病防治和消毒工作；负责卫生行政复议和对卫生执法的督察；对全市卫生监督监测工作进行指导。
　　（五）基层卫生与妇幼保健科
　　研究拟定农村卫生、社区卫生服务的发展规划和服务标准，指导初级卫生保健规划的实施。制订有关妇女儿童保健和提高人口素质工作的发展规划、政策措施和技术标准；监督母婴保健事项技术的实施，统筹协调健康教育工作。
　　（六）医政科
　　研究指导全市医疗机构改革，拟定医疗机构的发展规划、区域医疗机构设置规划、管理规章、服务标准和医疗技术人员执业标准，监督医疗机构的医疗质量；制订全市临床医学重点专科建设规划；依法对医疗机构、执业医师执业情况进行监督管理；负责医疗广告的审核和社会办医的审核和审批；负责西医医疗事故鉴定；监督管理血站采供血及临床用血质量；协助县区和有关部门对重大人员伤亡事件实施紧急救护；承办驻马店市公民无偿献血领导小组的日常工作。
　　（七）疾病控制科
　　拟订传染病、地方病、慢性非传染性疾病及与公共卫生相关疾病的防治规划；组织对全市重大传染病、地方病和社区主要慢性非传染性疾病的综合防治；对杀虫剂实行监督管理；制订公共营养规划，管理营养性疾病的防治工作；组织调度全市卫生技术力量对重大突发疫情、病情实施紧急处置，防止和控制疫情、疾病的发生和蔓延。承担市爱国卫生运动委员会办公室的日常工作。
　　（八）中医科
　　研究拟订全市中医行业发展规划并组织实施；负责各类中医医疗机构的宏观管理和业务指导；组织科研课题的协作攻关、新药研制开发和科技成果的鉴定和推广；负责中医、中西医结合医疗机构和中医类别执业医师、护士的执业注册；负责中医医疗事故鉴定和中医医疗广告的审核；负责中医社会办医的审核和审批；组织中医药学术交流与技术合作；负责全市中医药职业技术教育、成人教育、师承教育的宏观管理。